DNA片段長度不穩(wěn)定,問題很可能出在DNA打斷環(huán)節(jié)。在NGS文庫構(gòu)建過程中,DNA片段化效果會直接影響后續(xù)測序質(zhì)量與數(shù)據(jù)一致性。實(shí)驗(yàn)過程中,很多實(shí)驗(yàn)室都曾遇到DNA片段長度分布不均、文庫峰型不穩(wěn)定、大片段殘留、DNA過度碎片化以及實(shí)驗(yàn)重復(fù)性不足等問題。這些問題的背后并不只是樣品因素,實(shí)際上,DNA打斷系統(tǒng)的穩(wěn)定性往往才是影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果的重要因素。
DNA打斷為什么會影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果?超聲波DNA打斷本質(zhì)上是利用超聲空化效應(yīng)對DNA進(jìn)行隨機(jī)剪切,在這一過程中,超聲能量穩(wěn)定性、溫度控制能力、超聲場均勻性和參數(shù)重復(fù)性都會直接影響最終DNA片段長度。尤其在NGS建庫、染色質(zhì)研究、宏基因組和微量DNA處理等應(yīng)用場景中,穩(wěn)定、可重復(fù)的DNA片段化已經(jīng)成為實(shí)驗(yàn)室越來越關(guān)注的核心指標(biāo)。
深那非接觸式DNA打斷儀正是圍繞超聲均勻性、穩(wěn)定輸出、精準(zhǔn)溫控和實(shí)驗(yàn)重復(fù)性持續(xù)進(jìn)行優(yōu)化,幫助實(shí)驗(yàn)室建立更加穩(wěn)定的DNA前處理體系。
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